برای مرتب کردن پوشه‌ها می‌توانید نام آن‌ها را تغییر داده یا آن‌ها را در گروه‌ها بر اساس نام،تاریخ و حجم دسته‌بندی کنید. ولی راه‌های بهتری هم برای این کار وجود دارد. می‌توانید آیکون پوشه را تغییر دهید ولی همیشه نمی‌توان آیکون مناسب برای همه پوشه‌ها پیدا کرد. راه بهتر عوض کردن رنگ پوشه‌ها خواهد بود ولی متاسفانه ویندوز اجازه تغییر رنگ پیش‌فرض را نمی‌دهد. ولی شما می‌توانید از نرم‌افزارRainbow Folders استفاده کنید. با این نرم‌افزار می‌توانید به راحتی رنگ هر پوشه‌ای را تغییر دهید.
استفاده از این نرم‌افزار بسیار ساده است. پس از دانلود فایل ZIP، آن را استخراج کرده و فایل setup را اجرا کنید. Setup از شما در مورد اضافه کردن Rainbow Folders به منو راست کلیک سوال خواهد کرد. توصیه می‌کنیم اجازه این کار را بدهید چون تغییر رنگ پوشه انتخاب شده را بسیار ساده خواهد کرد (مثل تصویر زیر).
این نرم‌افزار تنظیمات زیادی را در اختیار شما قرار می‌دهد. می‌توانید آیکون برنامه را از بین Classical، Typical و Modern انتخاب کنید. همچنین می‌توانید High contrast icons را برای داشتن کیفیت بهتر فعال کنید. قدم بعدی انتخاب رنگ خواهد بود.
اگر رنگی پیدا کردید و از آن خوشتان آمد می‌توانید آن را به Favorites اضافه کنید تا بعدا دوباره بتوانید از آن استفاده کنید. اگر نمی‌خواهید وقتتان را برای پیدا کردن رنگ صرف کنید، نرم‌افزار می‌تواند به صورت تصادفی یک رنگ به پوشه اختصاص دهد. همچنین می‌توان tooltip دلخواه برای پوشه تعیین کرد.
یکی دیگر از امکانات خوب این نرم‌افزار امکان تغییر رنگ چند پوشه با هم است. برای این کار Multiple Select را از قسمت بالا سمت چپ انتخاب کنید و سپس پوشه‌هایی را که قصد تغییر آن‌ها را دارید را انتخاب کنید. پس از انجام تغییرات دلخواه روی Colorize کلیک کنید تا تغییرات اعمال شوند. برای بازگرداندن پوشه‌ها به حالت اولیه Decolorize را کلیک کنید.
در صورتی که تعداد پوشه‌های سیستم شما زیاد باشد Rainbow Folders می‌تواند به شما کمک کند. این نرم‌افزار با ویندوز‌های XP، Vista، 7 و 8 کار می‌کند.